根据中央对国有企业改革的统一战略部署，落实海洋强国和国家“一带一路”战略，应对航运业严峻挑战，做大做强做优，中远和中海两大集团推进实施了改革重组。考虑到集装箱业务整合的艰巨性、复杂性，中远海运集团率先对旗下两家国内最大的集装箱运输公司——中远集运和中海集运实施了深度整合。
整合后的中远海运集运，经营308艘集装箱船舶，运力达160.8万TEU，运力规模全球排名第四、亚洲第一，全球员工达25000多名，旨在打造具有国际竞争力的、世界一流的航运公司。
整合重生
两家集运公司的整合是集团整合中最为错综复杂的项目，是集团整合成功与否的标志性项目。
班轮公司整合工程浩大、过程艰巨而复杂，业界不乏失败案例。有的花费了很长时间才建立起统一的组织机构；有的整合过程中出现IT系统崩溃；有的客户大量流失。
而在集团统筹指挥和兄弟公司的大力支持下，中远海运集运充分认识整合难度，快速行动、全面融合，制定从总部到口岸、区域，再到网点、国家的整合方案和推进时间表，建立IMO推进工作机制，高效平稳推进了改革重组各项工作。2016年3月1日，新集运总部合署办公，明确了新的组织架构，总部设立26个部门，并妥善配备了总部和国内口岸的人员。接着，在短短6个月时间里，初步完成海内外网络的整合。3月1日—5月1日，只用了两个月的时间，就完成国内网络整合，9大口岸、近300家网点全部合署办公，统一了领导团队。4月12日到10月底，在集团领导下，在海外区域公司积极推动下，迅速完成了海外网络的整合与业务对接，涉及九大区域、104个国家与地区、近5000名中外员工。2016年底前，股权交易基本完成。
在信息系统领域，妥善快速地实施了全球信息系统切换。经过9个月的不懈努力，成功实现了涉及9大领域、21个核心系统、80个项目的扩容改造，经受住了数据量在短期内倍增的严峻考验。从5月在部分航线试点切换，到7月1日起全面实施，再到10月底全部订舱切入系统，比原计划提前了整整两个月。整合速度创造了业界纪录，令业内人士惊叹。
一次成功的企业整合=设计良好的整合计划+高质量的贯彻实施。
制定计划面临的挑战包括双方地位的协调、联盟的抉择、IT系统差异性和能力不足问题的解决、人力资源的配置、海外法律和社会环境的适应等。
贯彻实施面临的挑战主要来自于保持客户不流失、箱量不下降、业务不断不乱的压力、以及与合作伙伴的沟通、公共代理和合资方的选择和业务交接、新机构的运行和磨合、文化冲突与融合等。
为确保整合快速、有序推进，集运建立了IMO推进机制，协调全球整合。集运IMO团队根据集团明确的以“深度、快速”为原则的顶层设计方案和集运整合“十个统一”（IT系统统一、航线规划统一、箱管统一、客户营销与服务统一、运价管理统一、内贸集装箱全面统一、供应商管理统一、全球网络及支线统一、联盟统一、有竞争力的薪酬与激励机制统一）的重要要求，确定了具体实施方案，并坚决推进，高效执行。
集运整合方案的核心，在于促使“三张网”的合二为一：组织架构和海内外网络的合二为一，即营销和服务网络整合；航线网络的合二为一；信息系统的网络合二为一，即操作和流程的统一。
围绕这三张网的整合，全体船岸员工团结协作，克服重重困难，不断解决重点难点问题，按时间表平稳高效加以推进。
整合后协同效应逐步释放，公司效益明显改善。
加速出发2016年我国外贸形势异常复杂严峻，以美元计价的中国外贸进出口总额比上年下降6.8%。集运市场尽管运力增速略有放缓，但需求依然严重不足，运价加速下滑。CCFI指数于4月创下历史新低的632点，情况比2009年金融危机时更差。面对空前的困难与挑战，在集团的正确领导下，中远海运集运围绕集团精心作出的顶层设计，上下一心，主动作为，坚定不移推动改革重组，为全力以赴打好效益攻坚战拼尽了全力。
改革重组后的2016年3－12月，新集运实现提单箱量1258万TEU，在前所未有的市场低谷中逆市增长0.2%，基本实现了整合元年“货量不流失”的目标，打破了咨询公司关于整合后货量流失10%以上的预测，更打破了“业内整合元年货量必然下降”的惯例。整合后，新集运的单月亏损额同比整合前分属两家经营时，明显收窄，11、12月更实现扭亏为盈。2016年11－12月相比2015年同期，运价、油价差距不大，外部环境并无实质差异，但效益却有根本转变，凸显了整合后的规模效应。
2017年，新集运深化协同效应，充分释放改革红利，聚焦“增长”主题，取得了丰硕成果：全年提单箱量比2016年增长了15.5%；单箱收入增长了13.8%；单箱成本下降了2.2%；总收入增长了30.4%；利润总额比2016年大幅扭亏为盈。从同业对标情况看，新集运也有不俗表现，盈利能力大幅提升，全年EBIT率及其增幅均高于同业。货运量逐步赶超，特别是第三季度单季货运量首次超越行业领先者。单箱成本降幅最大，单收实现两位数增长。全年货量规模和增幅双双领先。
整合之初，集运提出了“ABETTERONE”的口号，在整合期间贯穿始终；系统切换后，集运向外界郑重宣告“WeAreReady”；整合完成后，立足“为客户传递价值”，又提出了“WEDELIVERVALUE”。这三个语句，堪称集运在整合重组不同阶段的缩影，赢得了市场与客户的认可与赞誉。
“不忘初心，方得始终”，中远海运集运正朝着打造具有国际竞争力的世界一流班轮公司的目标前进。